ምርቶች

የፕሮቲን-ሰፊ ፎስፈረስ ክውነቶች ትንተና አሁንም ትልቅ የትንታኔ ፈተና ነው ምክንያቱም የፕሮቲን ፎስፈረስ ኔትወርኮች በጣም ውስብስብነት።በዚህ ሥራ ውስጥ የፎስፎፕሮቲኦም ዓለም አቀፋዊ ትንታኔን ለማገዝ ያላቸውን ችሎታ በተመለከተ የ Lys-N, Lys-C እና ትራይፕሲን ማሟያነት እንገመግማለን.የተጣራ የዝቅተኛ ፒኤች ጠንካራ cation ልውውጥ እትም N-terminally acetylated፣ phosphorylated እና ያልተሻሻሉ peptides በብቃት ለመለየት ጥቅም ላይ ውሏል።በአጠቃላይ 5036 ያልተደጋገሙ phosphopeptides የሶስቱን ኢንዛይሞች ጥምረት በመጠቀም <1% ከ 1 mg ፕሮቲን የውሸት ግኝት መጠን ሊታወቅ ይችላል።የኛ መረጃ እንደሚያሳየው በተለያዩ ፕሮቲኤሶች በሚፈጠሩት የphosphopeptide ዳታ ስብስቦች መካከል ያለው መደራረብ አነስተኛ ሲሆን በተመሳሳይ ሁኔታ በተፈጠሩት ሁለት ትሪፕቲክ ዳታ ስብስቦች መካከል ያለው መደራረብ ቢያንስ 4 እጥፍ ከፍ ያለ ሆኖ ተገኝቷል።በዚህ መልኩ የ Lys-N እና ትራይፕሲን በትይዩ ጥቅም ላይ መዋላቸው የተገኙት የፎስፖፔፕቲዶች ቁጥር በ72 በመቶ ከፍ እንዲል አስችሏል d ከትራይፕሲን ጋር ሲወዳደር ትራይፕሲን የተባዛ ሙከራ ግን 25 በመቶ ብቻ እንዲጨምር አድርጓል።ስለዚህ፣ በትሪፕሲን እና Lys-N መረጃ ላይ ብቻ ስናተኩር፣ 4671 ተደጋጋሚ ያልሆኑ phosphopeptides ለይተናል።በተገኙ ቦታዎች ላይ ተጨማሪ ትንታኔ እንደሚያሳየው የላይስ-ኤን እና ትራይፕሲን መረጃ ስብስቦች በከፍተኛ ደረጃ በተለያዩ የፎስፈረስ ምስሎች የበለፀጉ ሲሆን ይህም የባለብዙ ፕሮቲን አቀራረቦች በ phosphoproteome ትንታኔዎች ውስጥ በጣም ጠቃሚ መሆናቸውን የበለጠ ያረጋግጣል።